Аналоги білка APOBEC3G у тварин
Подібну функцію щодовірусу SIVу клітинах мавп виконує білок Vif SIVmac, який має лише 30% подібності за амінокислотною послідовністю з Vif ВІЛ-1. Vif-білки інших лентивірусів приматів з віддаленим ступенем спорідненості (наприклад, SIVagm) не діють на APOBEC3G, оскільки не зв'язуються з цим білком людини.
Таким чином, функції білківAPOBEC3Gлюдини та мавп є видоспецифічними. Заміна лише однієї амінокислоти в APOBEC3G може призвести до зникнення противірусної активності цих білків до ВІЛ та SIV у клітинах людини або мавпи відповідно. Заміна аспартату в APOBEC3G людини на лізин (як у гомологічній позиції APOBEC3G африканської зеленої мавпи - AGM) призводить до того, що мутантний білок людини набуває здатності реагувати з білком Vif мавпячого вірусу SIV і втрачає здатність реагувати з білком.
І навпаки, заміна однієї мавпою амінокислоти на людську в мавпячому APOBEC3G робить його здатним зв'язуватися з білком Vif людського вірусу ВІЛ-1. Крім того, заміна єдиної амінокислоти в консервативній ділянці Vif може спричинити зниження його активності. За іншими даними, APOBEC3G людини може проявляти противірусну активність як проти ВІЛ, так і проти ретровірусних мишачих векторів, що продукуються клітинами миші та людини. Навпаки, мишачий APOBEC3G не пригнічує інфекційну здатність мишачих ретровірусних векторів, але проявляє противірусну активність у клітинах людини щодо віріонів ВІЛ-1 дикого типу, так і мутантних вірусів з делецією гена vif.
Відсутність ефекту щодомишачихретровірусів може пояснюватися відсутністю зв'язування білка Gag вірусу мишачої лейкемії (MLV) змишачим APOBEC3G. Ці результати свідчать, що мишачий гомолог APOBEC3G блокує ВІЛ-1 з допомогою іншого механізму. Очевидно, грає роль взаємодія клітинних білків із вірусом. Більш того, ізоляти ВІЛ-2, які не мають vif, можуть рости в лініях клітин, що не підтримують ВІЛ-1 інфекцію, що не мають vif. Ці результати, швидше за все, свідчать про існування інших внутрішньоклітинних механізмів придушення ВІЛ-2. У зв'язку з цим інші дані свідчать про те, що APOBEC3G може впливати на механізми, пов'язані та не пов'язані з редагуванням РНК.
Необхідно відзначити, що цей клітинний білок здатний каталізувати дезамінування цитидину в одноланцюговій ДНК, але не в дволанцюжковій ДНК і не в гібридних молекулах ДНК/РНК. APOBEC3G також може пригнічувати реплікацію вірусів гепатиту В та HTLV за допомогою механізму, відмінного від дезамінування цитидину. Про це свідчать результати нещодавно проведених досліджень, які показали, що APOBEC3G і APOBEC3F можуть блокувати розмноження ВІЛ не тільки за рахунок «виштовхування» його в гіпермутагенез. Також може грати роль здатність цих білків перешкоджати накопиченню зворотних транскриптів. Інші дослідження показують, що інтерферон може активувати APOBEC3G у клітинах печінки та макрофагах, але не в Т-лімфоцитах.
Цей процес не пов'язаний з індукцією STAT-1. Ці дані свідчать, що взаємодія інтерферону-а з APOBEC3G може призводити до реалізації інших противірусних механізмів у клітинах печінки та макрофагах.
Нарешті, було показано, щоекспресіяу клітині не тільки APOBEC3F, APOBEC3G, АРО-BEC3DE, а й АРОВЕСЗВ може придушувати інфекційний процес як у разі ВІЛ з делецією гена vif, так і у разі ВІЛ дикого типу на етапах до їх інтеграції до хромосом.клітини. АРОВЕСВ зв'язується з нуклеокапсидним доменом трансляту Gag ВІЛ і таким чином може включатися до дочірніх віріонів. АРОВЕСВ не пов'язується з Vif ВІЛ-1 і тому на нього не впливає експресія Vif.
Він не виробляється лімфоцитами в нормі, але примусова активація експресії в цих клітинах може призводити до інгібіції ВІЛ-інфекції.
