Crysis Warhead, безпосередній розвиток сюжету у грі, вступний ролик та короткі передумови
Події в грі розвиваються паралельно до подій, що відбувалися в Crysis, але в іншій частині острова. Протагоністом у грі є один із найпомітніших і центральних персонажів оригіналу — сержант Майкл Сайкс (sergeant Michael Sykes) на прізвисько Псих (Psycho), який за походженням британець, а не американець.
Безпосередній розвиток сюжету у грі
У грі є 7 ігрових рівнів. Кожен рівень представлений однією неподільною локацією. Після закінчення поточного рівня відбувається завантаження наступного. Усередині самих рівнів завантажень немає, оскільки підвантаження ігрових даних здійснюється динамічно.
Вступний ролик та короткі передумови
Називайте мене Ізмаїл (Call me Ishmael)
Події на початку першого рівня починаються відразу після закінчення вступного ролика. Псих вилазить із розбитого VTOL'у і поодинці рухається місцевістю, поки йому на шляху не зустрічається корейський гелікоптер, який транспортує невідомий контейнер. З Психом відразу ж зв'язується начальник штабу Емерсон і каже йому, що в контейнері знаходиться ядерна боєголовка і його новою місією стає її захоплення. Крім того, процесом транспортування цього вантажу керує полковник Лі (Colonel Lee). Рухаючись дорогою до узбережжя, Псих зв'язується з Шоном О'Нілом (Sean O'Neill), пілотом винищувача F-35C, який є його старим добрим другом. Вийшовши до узбережжя, Псих стає свідком масованого бомбардування острова та ворожих кораблів. «Зачистивши» село від ворожих солдатів, він стає свідком того, як два корейські винищувачі підбивають винищувач з О'Нілом, який згодом падає в глибині острова.
Берегова відпустка (Shore Leave)
Емерсон дає Сайксу завдання зняти камеру з винищувача, що впав.О’Ніла. Виконавши завдання і зустрівши О'Ніла, що вижив, вони рухаються узбережжям до порту, в гавані якого знаходиться підводний човен, готовий забрати контейнер з острова. Знищивши персонал та охорону порту під прикриттям О'Ніла на VTOL'і, Псих залазить у трюм підводного човна, де виявляє контейнер. Виявляється, що вантаж — не ядерна боєголовка, а інопланетний механізм, аналогічний тому, який кілька разів атакував загін «Хижак». Несподівано інопланетний робот генерує електромагнітний імпульс, який "вирубує" Психа. Прокинувшись, Псих опиняється у полоні у полковника Лі. Полковник дає наказ вбити Сайкса, проте, перш ніж корейський солдат встиг застрелити Психа, відбувається несподіване миттєве розширення крижаної сфери, внаслідок чого корейці миттєво заморожуються.