Еволюція регуляторних механізмів
Питання порівняльної біохімії опинилися у центрі уваги низки наукових шкіл.
Так, вивчається розподіл каріозину та анзерину у тваринному світі (В. С. Гулевич), біохімія м'язового скорочення, фосфорний та вуглеводний обміни у м'язах на різних етапах філогенезу тваринного світу (Є. М. Крепе). Серія робіт з порівняльної фізіології секретину та травних ферментів (трипсину та пепсину) була проведена в 30-ті роки П. А. Коржуєвим. Виявляються закономірності у розподілі деяких олій серед рослин та залежність складу олій у рослині від географічного походження останнього (С. Л. Іванов).
Великий досвід вивчення закономірностей перетворення речовин в онто- та філогенезі рослин накопичений А. В. Благовіщенським. Згідно з Благовіщенським, підйом на більш високий енергетичний ступінь здійснюється в ході біохімічної еволюції через своєрідний ароморфоз (арохімоз). У 30-х роках В. І. Нілов виявив паралелізм у розвитку хімічних процесів у організмів, підпорядкувавши це явище закону гомологічних рядів М. І. Вавілова.
Еволюційно-біохімічні дослідження показали, що біохімічні системи, причетні до основних проявів життєдіяльності, виявляють загальний план будови у межах широкого ряду тваринних форм. Так, універсальним механізмом виявився біохімічний механізм скорочення м'язових волокон. В. А. Енгельгардт та М. Н. Любімова встановили, що джерелом енергії для роботи м'язів є аденозинтрифосфат (АТФ). Подальші дослідження показали, що будь-який скорочувальний акт чи рух, властиві рослинам та тваринам, здійснюються за рахунок енергії АТФ.
Е. Чаргафф на початку 50-х років виявив, що ДНК має видоспецифічність. Це дозволило дослідити зв'язок філогенетичної систематики зособливостями будови нуклеїнових кислот Відповідно до А. Н. Білозерського та А. С. Спіріна, специфічність нуклеїнових кислот виявляє зв'язок зі становищем організмів у філогенетичній системі.
У роботах В. П. Скулачова було вивчено молекулярні основи еволюції регуляторних механізмів. Якщо більшість інших біохімічних механізмів виявляє єдність у межах всього органічного світу, то регуляція обмінних процесів виявилася диференційованішою і досконалішою у багатоклітинних організмів у порівнянні з одноклітинними. Наявність нервової та гормональної систем регуляції біохімічних процесів робить тварин біохімічно досконалішими порівняно з бактеріями та рослинами.