Розроблено новий метод раннього виявлення стійкості у мікобактерій туберкульозу.
Як і всі види нашої планети, бактерії постійно розвиваються. Деякі зміни, що відбуваються в їх ДНК, роблять ці мікроорганізми стійкими до ліків, які використовують для лікування від викликаних ними захворювань.
Лікарсько стійкі бактерії зазвичай виживають під час лікування та передають свої гени іншим бактеріям, що призводить до накопичення лікарсько-стійких форм. Найкращим вирішенням цієї проблеми є лікування пацієнтів правильно підібраним антибіотиком на самому початку захворювання, але це нелегко. Лікарі спочатку повинні ідентифікувати бактерії пацієнта, що заразили, потім з'ясувати, до яких препаратів вони стійкі. Результатів тесту часом доводиться чекати тижні та місяці.
На цій стадії розробки вчені обрали два види патогенних бактерій людини: Staphylococcus aureus та Mycobacterium tuberculosis. Дослідники використовували дані про відомі варіанти генів цих видів, які дають бактеріям стійкість до різних видів антибіотиків. За результатами проведеного тестування точність передбачень виявилася досить високою. Для S. aureus стійкість до 12 антибіотиків програма правильно передбачає в 99,1 відсотках випадків, а для M. tuberculosis у 82,6 відсотках випадків, що, ймовірно, пов'язано з меншою вивченістю генетичних механізмів стійкості цього виду.
Експериментальне визначення стійкості культури бактерій до антибіотиків займає досить багато часу - від одного дня у випадку S. aureus до кількох тижнів у випадку M. tuberculosis. Використання Mykrobe Predictor може значно скоротити час підбору відповідних антибіотиків. На відміну від існуючих методів, нове програмне забезпечення можеоновлюватися, тобто ставати краще з часом. Воно також може виявляти інфекції навіть у тому випадку, якщо бактерії вже були піддані впливу якихось ліків, але все ще присутні в організмі.
Дослідники протестували програму, використовуючи її для аналізу понад 4500 ретроспективних зразків пацієнтів, підбираючи антибіотик до двох небезпечних бактерій туберкульозу (ТБ) та золотистого стафілококу. Програмне забезпечення вже випробувано у лікарнях у Лідсі, Брайтоні та Оксфорді.