Безпородний пітерський кіт виявився попереду всіх за генетичною різноманітністю
Вчені прочитали повний геном домашньої кішки і з'ясували, що за ступенем генетичного розмаїття безпородний вуличний кіт з Пітера вищий за чистокровну абіссинську кішку і дикого лісового кота.
Мертвий бізон подружив США та Україну
Кішки - найпопулярніші сьогодні домашні тварини, на сьогодні у світі налічується близько 600 мільйонів хвостатих-вусатих, що мешкають поруч із людиною. Людина одомашнила кішку пізніше, ніж собаку. Собака став другом людини близько 15 тис. років тому, ще за часів мисливців-збирачів, причому активно допомагав людині на полюванні, в охороні, потім пас худобу і виконував багато інших функцій.
Перші одомашнені кішки з'явилися близько 10 тис. років тому, коли людина почала освоювати сільське господарство.
Очевидно, дикі кішки просто забредали до людських поселень і приживалися там. Причому їхня користь у господарстві порівняно з собаками була нікчемною, ну хіба що мишей ловили, зате вони були привабливими і поступово стали дружелюбними. Загалом можна перечитати Кіплінгову «Кішку, яка гуляла сама по собі» і уявити, що воно приблизно так і було.
Процес одомашнення, звісно, супроводжувався генетичними змінами.
Насамперед відбувався відбір за поведінкою: відбраковувалися мутації агресивності та страху та накопичувалися мутації, що підвищують дружелюбність.
Еволюція грає в Lego
Ну а після того, як кішка тисячоліття жила поруч із людиною, люди перейнялися її зовнішнім виглядом і протягом останніх 200 років інтенсивно займаються селекцією, виводячи нові декоративні породи. Потужний штучний відбір закріплює гени забарвлення, довжини вовни, форми морди та інше, але він тягне за собою гени зовсім інших ознак.
«У процесі відборузалучаються так звані хітч-хайкінг-гени, які впливають на метаболізм, репродукцію та інші біологічні риси», - розповів Стефан О'Брайан.
Вони описали понад 700 тис. консервативних елементів, які однакові у кішок та інших ссавців, знайшли понад 10 млн однонуклеотидних варіацій, що відрізняють кішок один від одного, і т.п.
«Одним із завдань було оцінити варіабельність між індивідуумами, — додав Стефен О'Брайан. — Для цього ми порівнювали геноми домашніх котів між собою та з геномом дикого кота». Секвенування геномів проводили в США, Вашингтонському університеті в Сент-Луїсі, і в Китаї.
Перша генетично вивчена кішка - домашня кішка на прізвисько Синемен (cinnamon - кориця) абіссинської породи, що живе в Сент-Луїсі, США. Як пояснив Гайк Тамазян, ця порода вирізняється найбільшою генетичною однорідністю. Її генетична різноманітність у ході селекції звелася до мінімуму. Це означає, що на обох хромосомах цієї кішки гени, які дісталися їй від батьків, майже однакові.
"Я не обіцяв Путіну, що ми обов'язково клонуємо"
Геном пітерського безпородного кота Бориса, який живе на вулиці, але перебуває на забезпеченні вчених,
продемонстрував найбільшу генетичну різноманітність. І виявився набагато ближчим до дикого кота, ніж геном абіссінки. У той же час його розмаїтість навіть вища, ніж у дикого.
Як пояснює Тамазян, на диких тваринах теж діє відбір — природний. А домашні безпородні не мають жодного тиску відбору, ні природного, ні штучного. Живуть поруч із людиною, мають дах над головою, харчування та ветеринарну допомогу. Та й на відміну від породистих кішок безпородним люди не підбирають пару для розмноження.
Як підкреслюють дослідники,Вивчення геному домашньої кішки може принести практичну користь для медицини. По-перше, для ветеринарної медицини: вже сьогодні у кішок описано 250 спадкових хвороб і відкриють ще більше. А по-друге, для багатьох небезпечних для людини вірусів (у тому числі коронавірусу, вірусу герпесу) популяції диких кішок є природним резервуаром.
Роль українських дослідників у Санкт-Петербурзі у цій роботі полягала в аналізі даних котячих геномів біоінформатичними методами.
Роботу ще далеко не закінчено. Так, наприклад, щоб простежити всі генетичні зміни, що відбулися у домашньої кішки, потрібно провести ще багато досліджень.
Центр геномної біоінформатики ім. Ф.Г. Добржанського було організовано у 2011 році за мегагрантом. Вчені працюють далеко не лише над геномом кішок, а й над раковим геномом. Але, як зізнався Стефен О'Брайан, складнощі виникають і з отриманням грошей, і з різними бюрократичними процедурами.
І керівник, і його співробітники очікують, що на роботі відобразиться падіння курсу рубля.
Реактиви купуються за кордоном, секвенування теж проводиться за кордоном, платити за це доводиться, звісно, не в українській валюті. А грант обчислюється у рублях.