Довідник нуклеотиди та нуклеїнові кислоти, Практична молекулярна біологія
Нуклеотиди, нуклеїнові кислоти.
Головна. Новини. Про проект. Довідник. Рестриктази. Методи. Розчини. Розрахунки. Огляди. Навчання. Посилання. Завантажити сайт. Освітні ресурси.
Хімічна структура нуклеотидів.
Позначення поліморфних нуклеотидів.
| Символ | Позначає | Пояснення |
| G | G | Guanine |
| A | A | Adenine |
| T | T | Thymine |
| C | C | Cytosine |
| R | A або G | puRine |
| Y | C або T | pYrimidine |
| M | A або C | aMino |
| K | G або T | Keto |
| S | C або G | сильна /Strong/ взаємодія - три водневі зв'язки |
| W | A або T | слабка /Weak/ взаємодія - два водневі зв'язки |
| H | (A, C, T) але не G | H слідує за G в алфавіті |
| B | (C, G, T) але не A | B слідує за A в алфавіті |
| V | (A, C, G) але не T(U) | V слідує за T(U) в алфавіті |
| D | (A, G, T) але не C | D слідує за C в алфавіті |
| N | (A, G, C, T) | будь-яка основа / Nucleotide |
Молекулярна вага нуклеїнових кислот.
Base = 324.5Da Base pair = 649Da Ribo Base = 340.5Da 1kb ds DNA (Na) = 6.5x10 5 Da 1kb ss DNA (Na) = 3.3x10 5 Da 1kb ss RNA (Na) = 3.4x10 5 Da розмір: на 1Angstrom припадає 1.05 підстав.
Конверсія: маса -> молі(NA).
1µg/ml DNA = 3.08µM фосфатів 1µg/ml 1kb фрагмента = 3.08nM 5'-кінців 1µg 1kb фрагмента = 1.54pmol = 9.3x10 11 молекул 1µg 1kb фрагмента = 3.08 1pmol 1kb фрагмента = 0.65µg