Етап синтезу вірусних компонентів
Незабаром після оголення вірусного геному відбувається зменшення або зникнення інфекційності, оскільки віріонів як таких вже не існує, а інфекційність нуклеїнової кислоти набагато менше інфекційності повних віріонів. Дане явище було названо екліпсом (затемненням), а фаза вірусної інфекції з моменту адсорбції і до появи в клітині нових інфекційних віріонів – екліпсфазою, або латентним періодом. При високій множинності зараження клітин деяка частина віріонів зберігає інфекційні властивості протягом усієї екліпс-фази, що часто ускладнює визначення її тривалості.
Протягом цього періодувідбуваються всі суттєві процеси вірусної репродукції, що призводять до утворення вірусних компонентів та формування нового потомства віріонів. З появою у клітині перших новостворених синтезованих віріонів завершується екліпс-період розмноження вірусу.Процеси, що відбуваються в екліпс-фазі, схематично показані на малюнку, де як приклад представлені основні етапи реплікації аденовірусів.
З представленої схеми видно, що після прикріплення віріон входить в клітину і частково або повністю позбавляється оболонки, оголюючи вірусний геном. Деякі ранні вірусні гени транскрибуються з утворенням мРНК, які можуть змінюватися різними шляхами, включаючи сплайсинг. Ранні мРНК транслюються з утворенням трьох основних продуктів: білків, які пригнічують або зупиняють синтез білків та нуклеїнових кислот; білків, що регулюють експресію вірусного геному; ферментів, необхідні реплікації вірусних нуклеїнових кислот. Після реплікацією вірусної нуклеїнової кислоти транскрибируются пізні вірусні гени, продуктами трансляції яких у основному структурні вірусні білки,використовуються при збиранні нових віріонів. Деякі з них зазнають посттрансляційних змін перед включенням до структури віріонів. У кожній інфікованій клітині утворюються сотні та тисячі віріонів, які, звільняючись, заражають інші клітини.
У більшості ДНК-вірусівтранскрипція та реплікація ДНК відбувається в ядрі клітини, з використанням клітинної РНК-полімерази II та інших клітинних ферментів. Більшість РНК-вірусів розмножується в цитоплазмі, де відсутні ферменти, що копіюють РНК на РНК-матриці, тому вірусний геном повинен сам по собі функціонувати як мРНК або вірус повинен нести свою РНК-полімеразу, щоб транскрибувати РНК на геном РНК.
Синтез вірусних білківвідбувається лише у цитоплазмі клітини. В інфікованих клітинах вірусні нуклеїнові кислоти та виукраінспецифічні білки синтезуються у значно більшій кількості, ніж включаються у віріони. Надлишковий синтез структурних компонентів під час репродукції вірусів є своєрідною платою за паразитизм на генетичному рівні.
Нащадоквіріонівпроявляється через певний період після того, як почав здійснюватися синтез складових їх компонентів. Тривалість періоду від моменту інфікування до появи дочірніх віріонів досить варіабельна і відбиває глибоку різницю між різними вірусами.
Латентний період дрібних вірусів, що не мають оболонки та містять односпіральну РНК, триває приблизно 2 години і є найбільш коротким серед усіх відомих вірусів тварин. ДНК-віруси мають більш тривалий латентний період. Тривалий латентний період відмічено також у реовірусів та вірусу саркоми Рауса. У простих дрібних РНК-вірусів швидше протікає не тільки латентний період, але і весьцикл розмноження вірусу Віруси, геном яких виконує функції мРНК, мають коротший реплікативний цикл, ніж віруси, у яких функції мРНК виконує не віріонна РНК, а комплементарна їй мінус-нитка.
Розмноження ДНК-вірусівможе продовжуватися навіть через 24 години після зараження. Причини, що визначають тривалість циклу розмноження різних вірусів, не з'ясовано. Можливо, це пов'язані з складнішою послідовністю подій при репродукції великих, складно влаштованих вірусів.
Укорочення латентного періоду при високій множинності зараження було виявлено у різних РНК і ДНК вірусів і, можливо, пов'язане з прискоренням процесу утворення ферментів, що беруть участь у синтезі нуклеїнової кислоти. При високій множинності зараження не виключається роль капсидних білків у прискоренні початку циклу репродукції.
Число інфекційних вірусних частинок, що утворюються в одній клітині, залежить від типу вірусу, і кількість їх варіює дуже широко. Цікаво, що частку виукраінспецифічних продуктів припадає від 0,1 до 5% маси клітини тварини.