ФІЛОГЕНЕЗ ГРИБІВ
Походження базидіоміцетів досить неясно. Одні мікологи виводять їх із зигоміцетів, інші з аскоміцетів, зокрема з дискоміцетів. При цьому доводиться допускати, що базидіоспори мають, по суті, ендогенне походження: на гомологічній сумці базидії після редукційного поділу диплоїдного ядра утворюються чотири зовнішні випинання; кожне випинання входить ядро і цитоплазма, навколо яких утворюється нова оболонка (як навколо аскоспор), що відокремлює їх від каналу стеригми; іноді ця оболонка буває помітна, оскільки нещільно прилягає до зовнішньої оболонки (вип'яття) базидії. Аналогія такій освіті спор є у деяких зигоміцетів, де подібно розвиваються односпорові спорагіолі (хетокладіум та ін).
Статевий процес у базидіоміцетів морфологічно вкрай простий і виявляється у більшості у формі анастомозів двох вегетативних клітин міцелію. Спеціальних статевих органів ні в кого з представників базидіоміцетів немає; зате дикаріонтична фаза існує набагато більш тривало, ніж у аскоміцетів (крім тафринових) і продовжується майже протягом усього циклу розвитку.
Найбільш примітивні серед базидіоміцетів найпростіші холобазидіоміцети із зародковим плодовим тілом у вигляді плоского пухкого сплетення гіф, що має гіменофор гладкий. Подальша еволюція їх виявилася утворенні найпотужніших, по-різному влаштованих плодових тіл, з сильно збільшеною поверхнею гіменофора, що розвивають величезну кількість базидіоспор.
Зв'язок гастероміцетів з гіменоміцети незрозумілий; можливо, що декількома еволюційними рядами розвивалися з нижчих гіменоміцетів; з іншого боку, є нечисленні прихильники теорії походження агарикових з гастероміцетів.
Фрагмобазидіоміцети рано відокремилися віднайпростіших холобазидіоміцетів. У тому числі порядки з плодовими тілами, мабуть, первинні.
Різне положення перегородок у фрагмобазидіях у дрожалків'гх (Tremellales) і аврікулярієвих (Auriculariales) малює ці два порядки як дві самостійні лінії еволюції. Але переходи у формах фрагментації базидії приводять до висновку, що ці порядки могли з'явитися від загального предка. Тановим, найвірогідніше, був якийсь таксон із холобазидіальних грибів, близький до примітивних Aphyllophorales. Що стосується сажкових (Ustilaginales) і іржових (Uredinales), то, враховуючи поперечне положення перегородок у їх базидіях, можна говорити про споріднений зв'язок з Auriculariales. Це підтверджується й іншими, більш особливими особливостями організації. Головневі та іржі, виникнувши від загального предка,
еволюціонували незалежно один від одного. У зв'язку з паразитним існуванням вони втратили плодові тіла, які були у їхніх предків, зате виробили багато спеціальних пристосувань як у способі життя (у іржі), так і в морфології. Конідіальні форми у багатьох вищих грибів, особливо в аскоміцетів, у зв'язку з регресом або втратою статевого процесу набули фізіологічної та морфологічної незалежності; в систематиці грибів це дало підставу для виділення їх в окрему таксономічну групу недосконалих грибів.