Дволанцюжкова структура - Велика Енциклопедія Нафти та Газа, стаття 1
Дволанцюжкова структура
Дволанцюжкова структура та зазначені співвідношення підстав характерні для ДНК майже всього органічного світу, незалежно від джерела, з якого вони виділені. [1]
Дволанцюжкова структура та зазначені співвідношення підстав характерні для ДНК майже всього органічного світу незалежно від джерела, з якого вони виділені. [3]
Реально це здійснюється наступним чином: дволанцюжкова структура ДНК розкручується, ланцюги поділяються, тому що це було описано у разі подвоєння молекул ДНК (див. стор. ДНК починає комплектарно приєднувати до себе вільні рибонуклеотиди з навколишнього середовища. [4]
Ці фізичні властивості полімеру, а також дані рентгеноструктурного аналізу дозволяють припустити, що молекула полімеру являє собою довгу волокнисту дволанцюгову структуру і що ланцюги пов'язані один з одним водневими зв'язками, що виникають між аденіном одного ланцюга і тиміном інший ( фіг. [5]
Метод заснований на тому, що одноланцюжкова структура розщеплюватиметься при гідролізі хоча б по одному міжнуклеотидному зв'язку, у той час як для розщеплення дволанцюжкової структури необхідно, щоб розрив стався принаймні у двох місцях. Якщо припустити, що існування індукційного періоду при зниженні молекулярної ваги не є результатом початкового розриву водневих зв'язків в спеціальних ділянках молекули, то за допомогою кінетики гідролізу можна розрізнити одно-, дво-, триланцюгові структури або структури з великою кількістю ланцюгів. Далі, результати, отримані при дії панкреатичної ДНК-ази на ДНК із зобної залози теляти, показали, що мінімальна кількість нуклеотидів між розривами у двох ланцюгах, при якому зберігається двотяжка структура,дорівнює приблизно шести. [6]
Всі рибонуклеїнові кислоти являють собою полімери рибонуклеотидів, з'єднаних, як у молекулі ДНК, 3 5 -фосфорнодіефірними зв'язками. На відміну від ДНК, що має дволанцюжкову структуру, РНК є одноланцюжковими лінійними полімерними молекулами. [7]
Чи означає це, що в процесі полімеразної реакції копіюються обидва ланцюги нативної ДНК. На думку Вайсса [3], якщо копіюванню піддаються обидва ланцюги ДНК, то два ланцюги РНК, що утворюються, повинні бути взаємно комплементарні і можуть взаємодіяти один з одним, утворюючи дволанцюгову структуру . Саме це й спостерігається насправді. [8]
В даний час можна вважати твердо встановленим, принаймні для мікроорганізмів, той факт, що тільки один з двох ланцюгів ДНК (але ДНК при цьому повинна обов'язково мати дволанцюжкову структуру) транскрибується в РНК. [9]
Те, що після теплової денатурації ДНК є однотяжкою, було показано також дещо іншим способом. У разі РНК з пухлини Леттре - Ерліха нахил кривої (086) вказував на наявність однотяжної структури; у разі ДНК протягом перших 30 хв нахил кривої був 1 1, а потім зменшувався, але дволанцюгової структури при 95 для ДНК взагалі не було виявлено. Слід зауважити, що вивчення кінетики ферментативного гідролізу ДНК, денатурованої нагріванням може призвести до помилкових висновків. Дійсно, двоспіральні структури, які заново утворюються при охолодженні (або з одного і того ж, або з різних ланцюгів), можуть виявитися досить стійкими, і кінетика їх гідролізу буде подібна до кінетики гідролізу дволанцюжкової ДНК дезоксирибонуклеазою. [10]
Дволанцюгові структури ДНК при нагріванні, екстремальних значеннях рН, обробці сечовиною можуть переходити у формуневпорядкованих клубків – денатуруватися. Молекули нуклеїнових кислот максимально поглинають ультрафіолет при 260 нм за рахунок поглинання азотистих основ. Розчин нативної ДНК має при 260 нм оптичну щільність на 40% нижче оптичної щільності суміші нуклеотидів -, гіперхромний ефект. Денатурація оборотна, якщо залишилися спіралізовані ділянки ДНК. Відновлення структури ДНК після видалення денатуруючого фактора (за рахунок комплементарного спарювання основ нуклеотидів) називається ренативацією ДНК. На явищі денатурації ренативації ґрунтується метод гібридизації. [11]
Денатурацією називають процес руйнування дволанцюжкової вторинної структури ДНК. У минулому було не зовсім ясно, чи обов'язково при цьому відбувається розподіл ланцюгів. Можна легко уявити руйнування дволанцюжкової структури ДНК і без поділу ланцюгів. Денатуруючі агенти часто викликають і більш глибокі зміни, наприклад нагрівання призводить до зменшення числа пуріїових основ полінуклеотидних ланцюжках. [12]
Утворення подібних ділянок може впливати на утворення ядер, зменшуючи швидкість ренатурації, та на процес подальшої спіралізації. Якщо взаємодіють два ланцюги із стабільними спіральними ділянками, може статися лише часткова ренатурація. Тому ренатурацію важливо проводити за умов, у яких освіту внутрішніх двоспіральних ділянок зведено до мінімуму, тоді як дволанцюжкова структура ще досить міцна. [13]
Гра в тРНК або як робити конюшинне листя виглядає наступним чином. Кожному гравцеві дається випадкова послідовність N одиниць, що належать до чотирьох класів - А, У, Г, Ц, і тетраедрическая кістка, кожна грань якої відповідає одній з цих букв. Гравці кидають кістку по черзі і, заповнюючи певне місце упослідовності буквою, що випала, кожен гравець прагне отримати дволанцюгову структуру з максимальним числом пар АУ і ГЦ. Гра закінчена, коли один із гравців оголошує, що він отримав повну структуру. Перемагає гравець, який набрав на цей момент максимальну кількість очок. Окуляри зараховуються за пари; можна, наприклад, давати два очки за пару ГЦ та одне очко за АУ. Для кожної петлі в структурі повинні залишатися неспареними не менше 5 положень (порівн. містить максимальну кількість підстав, які можуть спаровуватися, проте конюшина дає можливість випробувати набагато більше комбінацій, так як окремі пелюстки можна зрушувати незалежно і з самого початку можлива набагато більша кількість комбінацій. Ейген.[15]