Інфекції дихальних шляхів
Інфекції дихальних шляхів (гострі респіраторні захворювання, ГРЗ) можуть спричинити бактерії, віруси та гриби. Серед бактеріальних збудників частіше зустрічаються Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Staphylococcus aureus, представники сімейства Enterobacteriaceae, Legionella pneumophila, збудники кашлюку та дифтерії. Серед вірусних збудників ГРЗ найбільше значення мають представники чотирьох сімейств РНК-вірусів (ортоміксовіруси, параміксовіруси, коронавіруси і пікорнавіруси) і двох сімейств ДНК-вірусів (аденовіруси, парвовіруси). Діти дошкільного віку схильні до ГРЗ, в середньому, 4–8 разів на рік, школярі – 2–6 разів на рік, дорослі – 2–3 рази на рік. У контингентах дітей, що часто хворіють, епізоди ГРЗ реєструються від 10 до 12 разів на рік. ГРЗ можуть протікати у легкій, у середньо-важкій та у важкій (круп, бронхіти, бронхіоліти, пневмонії) формах.
Загальними показаннями для лабораторного обстеження з метою проведення етіологічної діагностики ГРЗ є наявність у пацієнта гострого захворювання з локальними симптомами ураження дихальних шляхів за наявності загальноінтоксикаційного синдрому.
Інфекційні хвороби дихальних шляхів необхідно диференціювати від інших захворювань/станів неінфекційної природи (алергія, тромбоемболія легеневої артерії, ендокардит трикуспідального клапана, облітеруючий бронхіоліт, системні васкуліти, інфаркт легені, легенечна еози. бораторного обстеження. Слід брати до уваги, що пневмонії можуть розвиватися внаслідок інфікування збудниками особливо-небезпечних та природно-осередкових інфекцій (орнітоз, ку-лихоманка, легенева форма сибірки,туляремія та ін), у зв'язку з чим необхідно ретельно збирати та аналізувати епідеміологічний анамнез. У осіб із зниженою активністю імунної системи, ГРЗ можуть викликати також ентеровіруси, віруси герпесу, цитомегаловірус, кандиди, аспергіли, криптококи, пневмоцисти. Слід проводити диференціальну діагностику кашлюкової інфекції від гострих бронхітів, спричинених іншими збудниками. Диференційна діагностика грипу та інших ГРЗ можлива лише за допомогою лабораторних методів дослідження.
Лабораторні дослідження, що застосовуються з метою етіологічної діагностики інфекцій верхніх та нижніх дихальних шляхів, включають прямі (виявлення збудника, його геному та АГ) та непрямі (виявлення АТ) методи діагностики.
Мікроскопія (бактеріоскопія) забарвленого за Грамом мазка мокротиння та СМР дозволяє визначити лише домінуючий морфотип потенційного бактеріального патогену. Цінність методу і розв'язувані завдання різняться залежно від того, з якого локусу організму відібрано клінічний матеріал. Метою дослідження матеріалу зі стерильних локусів – кров, СМР, плевральна рідина тощо, є визначення домінуючого морфотипу потенційного бактеріального патогену та ставлення до забарвлення за Грамом. Крім того, виявляється характер запальної реакції (лейкоцитоз чи лімфоцитоз). Метою дослідження матеріалу з нестерильних локусів – мокротиння, БАЛ, що відокремлюється з вуха чи придаткових пазух, – служить визначення його придатності для бактеріологічного посіву та визначення характеру запалення. Критерієм придатності мокротиння є наявність менше 10 епітеліальних клітин і більше 25 нейтрофільних лейкоцитів у полі зору. Бактеріоскопія мазків з носо- та ротоглотки не інформативна, тому не проводиться.
Культуральний метод застосовується длявиділення та ідентифікації чистої культури патогену. У клінічній практиці метод використовують для виявлення бактеріальних збудників ГРЗ (Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae та ін) за винятком Mycoplasma pneumoniae та Chlamydophila pneumoniae. Бактеріологічний посів клінічного матеріалу проводиться з метою подальшої культуральної та біохімічної ідентифікації збудника, визначення антибіотикочутливості. Показанням для дослідження крові є пневмонія, септичні стани, менінгіт. Метод дозволяє виявляти збудник не більше ніж у 10-20% госпіталізованих хворих на позалікарняну пневмонію.
Серед вірусних збудників ГРЗ культивування можливе для вірусів грипу А та В, респіраторно-синцитіального вірусу, вірусів парагрипу 1–3 типів, метапневмовірусу людини та аденовірусів, проте як рутинна процедура цей метод використовується лише для вірусів грипу. Дослідження характеризується досить великою тривалістю, але незамінно за потреби детального вивчення патогенності, чутливості до антимікробних препаратів, антигенних та інших властивостей ізолятів мікроорганізмів. Аналітичні характеристики культуральних досліджень багато в чому залежать від якості середовищ, що використовуються, а також імунологічних і біохімічних ідентифікаційних тестів.
Для виявлення в мазках з респіраторного тракту АГ внутрішньоклітинних патогенів – Chlamydophila pneumoniae та вірусних збудників ГРЗ використовується ІХА та РІФ, для виявлення АГ вірусів грипу А та В використовується ІФА. Такі «швидкі тести» зручно використовувати в епідеміологічних цілях для масового скринінгу, але їх аналітичні характеристики можуть варіювати в широких межах залежно від набору реагентів, зберігання реагентів і навичок їхвикористання, у зв'язку з чим, вони можуть недовиявляти випадки інфікування в період епідемій (недостатня чутливість порівняно з культуральними методами та ПЛР) та давати хибнопозитивні результати у міжепідемічний період (низька специфічність).
Для виявлення АГ пневмокока, гемофільної палички та ряду інших бактеріальних патогенів у стерильних видах клінічного матеріалу (кров, СМР) застосовують латекс-аглютинацію; для дослідження матеріалу з нестерильних локусів (мокроту, БАЛ та ін) метод не призначений. Чутливість та специфічність наборів реагентів різних виробників становить 99–100% та 85–98% відповідно.
Виявлення фрагментів геному збудників інфекційних хвороб дихальних шляхів у більшості випадків найбільш ефективно та затребуване для ранньої діагностики та скринінгу з метою подальшого одержання чистої культури збудника. Для рутинних досліджень застосовуються тести на основі ПЛР, які дозволяють виявити РНК/ДНК патогенів у зразках біологічного матеріалу. Максимальний рівень специфічності та чутливості мають набори реагентів із використанням гібридизаційно-флуоресцентної детекції продуктів ампліфікації. Для діагностики захворювань, викликаних умовно-патогенними бактеріями, у зв'язку з їх можливим носієм у верхніх дихальних шляхах, доцільно застосовувати лише кількісні тести на основі ПЛР у поєднанні з дослідженням матеріалу з нижніх дихальних шляхів.
Виявлення специфічних АТ у сироватках хворих на ГРЗ методами ІФА, РТГА, РЗК призначене для ретроспективного підтвердження діагнозу при інфікуванні Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, Legionella pneumophila, Coxiella burnetii та вірусних інфекцій. Обмеженням такого способу діагностикиє необхідність підтвердження появи специфічних АТ (сероконверсії) 4-кратним наростанням титру специфічних АТ у зразках сироватки крові, отриманих послідовно у гострий період захворювання та у період реконвалесценції (через 10 днів – 1 місяць). Достовірність результату збільшується у разі проведення дослідження в обох сироватках одночасно. Визначення АТ IgM вважається більш цінним з клінічної точки зору, оскільки вони з'являються в ранні терміни інфікування і можуть бути маркером нещодавно перенесеної інфекції.