Відділ мікробіології - ФДБНУ - ЦНДІТ
У відділі мікробіології працюють 2 доктори та 3 кандидати наук, лікарі-бактеріологи, лікарі клінічної лабораторної діагностики.

У ФДБНУ «ЦНДІТ» працює з 1986 року. З 1998 р. – доктор біологічних наук, з 2007 р. має звання професора, з 2008 р. – керівник відділу мікробіології.
Л.М. Чорноусова є одним із провідних фахівців ЦНДІТ у галузі фундаментальних досліджень. Область наукових інтересів включає експериментальні дослідження туберкульозної інфекції, імунну відповідь при різних формах туберкульозу, аспекти патогенезу туберкульозу (мікробіологічні та молекулярно-генетичні характеристики розвитку експериментального туберкульозу, лікарська стійкість мікобактерій, тестована як мікробіологічними методами, так і визначенням точкових використанням RFLP, споліготипування, VNTR-типування). Наукові інтереси також пов'язані з вивченням механізмів розвитку лікарської стійкості M.tuberculosis, дослідженням найпоширеніших в Україні штамів мікобактерій туберкульозу Beijing кластеру та вивченням їхньої підвищеної трансмісивності.
Основна наукова тематика спрямована на молекулярно-епідеміологічні дослідження у фтизіатрії, розробку прискорених методів виявлення та визначення лікарської чутливості мікобактерій туберкульозу та створення сучасного алгоритму мікробіологічної діагностики туберкульозу та мікобактеріозів. Важливим розділом наукової діяльності є розробка підходів до вивчення ефективності хіміотерапії та тестування нових протитуберкульозних сполук, виявлення найбільш активних із них щодо МЛУ та ШЛУ штамів.
Під керівництвом Л.М. Чорноусової захищено 11 кандидатських та 2докторські дисертації.
Є керівником Центру передового досвіду Мережі супра-національних референс-лабораторій ВООЗ, членом Тематичної робочої групи з лабораторної діагностики туберкульозу при РГВУ з туберкульозу МОЗ України та ВООЗ, членом експертної групи з лабораторної діагностики туберкульозу при ФСВО мікробіологів та паразитологів ім. І.І. Мечнікова; членом Асоціації фтизіатрів Укаїни (РОФ) та Національної асоціації фтизіатрів (НАФ). Член Вченої ради ЦНДІТ та редколегії журналів «Бактеріологія» та «Вісник ЦНДІТ».
Читає лекції та проводить семінари для аспірантів та ординаторів ФДБНУ «ЦНДІТ» та лікарів-лаборантів із територій Україна та країн СНД.
Автор понад 100 друкованих праць, у тому числі 1 монографія та 3 розділи в монографії, 1 керівництво, 5 методичних рекомендацій федерального рівня, 5 патентів.
З 2015 року відділ мікробіології сертифікований Всесвітньою Організацією Охорони Здоров'я як Центр передового досвіду Мережі супра-національних референс-лабораторій ВООЗ.

Основні напрямки діяльності відділу мікробіології:
Фундаментальні дослідження спрямовані на вивчення біологічних властивостей M.tuberculosis, їх вірулентності, особливостей виживання в еукаріотичних клітинах, взаємодії патоген-господар залежно від кластерної приналежності M.tuberculosis, вивчення механізмів розвитку лікарської стійкості та шляхів поширення та передачі як M.tuberculosis різних генетичних кластерів, і нетуберкульозних мікобактерій.
Прикладні дослідження спрямовані на автоматизацію процедур молекулярно-генетичної та мікробіологічної діагностики туберкульозу, апробацію та впровадження інноваційних діагностичних тест-систем, оцінка їх значущості для практичної фтизіатрії, розробки нових підходів до видової ідентифікації туберкульозних та нетуберкульозних міко нових синтетичних та природних сполук щодо лабораторних та клінічних штамів M.tuberculosis в експериментах in vitro та ex vivo.
Клінічні дослідження спрямовані на виявлення туберкульозних та нетуберкульозних мікобактерій та визначення їх лікарської чутливості.
- Організаційно-методична робота представлена участю в курації регіональних спеціалізованих бактеріологічних лабораторій з метою вдосконалення якості мікробіологічних досліджень та інфекційного контролю у протитуберкульозних установах, розробкою нормативних документів, посібників та науково-методичних рекомендацій, викладацькою та експертною діяльністю.
- Співпраця з міжнародними організаціями.
- Діяльність як національний Центр передового досвіду мережі супранаціональних ТБ референс-лабораторій ВООЗ.
Відділ мікробіології включає 2 лабораторії:
Лабораторія мікробіологічної діагностики туберкульозу
Завідувач лабораторії — кандидат біологічних наук, старший науковий співробітник Ларіонова Олена Євгенівна

Лабораторія виконує такі дослідження:
- Бактеріоскопія діагностичного матеріалу на наявність кислотостійких бактерій
- Посів діагностичного матеріалу на щільному живильному середовищі та рідкому живильному середовищі в автоматичній системі ВАСТЕС MGIT
- Визначення лікарської чутливості мікобактерій туберкульозу до ПТП 1-го та 2-го ряду в автоматичній системі ВАСТЕС MGIT
- Визначення чутливості МБТ до піразинаміду PZA в автоматичній системі ВАСТЕС MGIT
- Визначення лікарської чутливості мікобактерій туберкульозу до лінезоліду, ПАСК, моксифлоксацину на рідкому живильному середовищі в автоматичній системі ВАСТЕС MGIT
- Виявлення та визначення лікарської чутливості нетуберкульозних мікобактерій
Лабораторія молекулярно-генетичних методів дослідження
Завідувач лабораторії — доктор біологічних наук, професор Чорноусова Лариса Миколаївна

У лабораторії виконуються такі види досліджень:
- Виявлення ДНК МБТ методом ПЛР як реального часу з діагностичного матеріалу
- Визначення чутливості МБТ до рифампіцину (RIF), ізоніазиду (INH) та фторхінолонів (FQ) методом ПЛР у режимі реального часу з діагностичного матеріалу.
- Виявлення ДНК МБТ та визначення ЛЧ до рифампіцину (RIF) у картриджі GeneXpert MTB\RIF
- Визначення чутливості до рифампіцину(RIF), ізоніазиду (INH) та фторхінолонам (FQ), аміноглікозидам\циклічним пептидам (AG\CP) та етамбутолу (EMB) на ДНК-стрипах з діагностичного матеріалу
- Ідентифікація культур на рід Mycobacterium методом ПЛР
- Визначення виду туберкульозних та нетуберкульозних мікобактерій на ДНК-стрипах
Провідні співробітники відділу мікробіології:
Севастьянова Еліна Вікторівна
Доктор біологічних наук, провідний науковий співробітник

З відзнакою закінчила Московський орден Трудового Червоного Прапора технологічний інститут харчової промисловості за спеціальністю «Технологія мікробіологічних та вітамінних виробництв». З 1994 року працює у відділі мікробіології ЦНДІТ. Неодноразово підвищувала свою кваліфікацію на курсах навчання організованих ВООЗ, CDC, МФОКК, Eagleson Institute, FILHA, IUATLD. Брала активну участь у численних проектах боротьби з туберкульозом, що здійснювалися в Україні за підтримки міжнародних організацій. В даний час — співробітник Центру передового досвіду Мережі супранаціональних ТВ референс-лабораторій ВООЗ, викладач навчальних курсів на базі Навчального центру ЦНДІТ, куратор регіональних лабораторій з діагностики туберкульозу, секретар Тематичної робочої групи «Лабораторна діагностика туберкулю туберкульозу в Україні при МОЗ України та ВООЗ, член Європейської лабораторної ініціативи з туберкульозу при Європейському бюро ВООЗ, член експертної групи ФСВОК за спеціальністю мікробіологічна діагностика туберкульозу, секретар секції Мікробіології та імунології туберкульозу Всеукраїнського науково-практичного товариства епідеміологів, мікробіологів. І.І. Мечникова (московське відділення), член Асоціації фтизіатрів України (РОФ).
Основні напрямки роботи: розробка оптимальних принципів організації роботи лабораторної мережі для діагностики туберкульозу; аналіз діяльності лабораторій та вдосконалення системи забезпечення якості мікробіологічних досліджень; інфекційний контроль у протитуберкульозних установах та забезпечення біологічної безпеки у спеціалізованих бактеріологічних лабораторіях; розробка нормативних документів, посібників та науково-методичних рекомендацій; викладацька та експертна діяльність. Автор понад 100 друкованих праць, у тому числі 6-ти навчальних посібників, 4-х федеральних клінічних рекомендацій, 5-ти посібників, 1-х методичних рекомендацій для лікарів та 1-го методичного посібника для лікарів.
Смирнова Тетяна Геннадіївна
Кандидат медичних наук, старший науковий співробітник

Закінчила український державний медичний університет у 1998 році медико-біологічний факультет, кафедра біохімії, спеціалізація – молекулярна біологія. Основні та суміжні спеціальності: лікар-біохімік, мікробіологія, лікар клінічної лабораторної діагностики. Працює у ФДБНУ «ЦНДІТ» у відділі мікробіології, у лабораторії молекулярно-генетичних методів досліджень із 1998 року. Співробітник центру передового досвіду Мережі супра-національних референс-лабораторій ВООЗ. Викладач навчальних курсів ЦНДІТ з питань мікробіологічної та молекулярно-генетичної діагностики туберкульозу та мікобактеріальних інфекцій, спеціаліст з навчання роботі на автоматизованій системі BACTEC MGIT 960, експерт з лабораторної діагностики фтизіатричного профілю, один із розробників нормативних документів.
Область наукових та клінічних інтересів: спеціаліст у галузі мікробіологічної та молекулярно-генетичної діагностикитуберкульозу та визначення лікарської чутливості мікобактерій, генотипування штамів M.tuberculosis complex (споліготипування, RFLP IS6110), удосконалення діагностики інфекцій, викликаних нетуберкульозними мікобактеріями, мас-спектрометричний аналіз білкових профілів мікобактерій та мікобактерій методів визначення протитуберкульозної активності знову синтезованих субстанцій in vitro та ex vivo. Автор понад 75 статей у зарубіжних та вітчизняних журналах, у тому числі 1-го навчального посібника, 4-х методичних рекомендацій та 3-х розділів у посібнику для лікарів. Автор 2-х патентів. Має сертифікат GCP.
Андріївська Софія Миколаївна
Кандидат медичних наук, старший науковий співробітник

Основна та суміжні спеціальності: лікар-біохімік, мікробіологія, лікар клінічної лабораторної діагностики. Закінчила медико-біологічний факультет, кафедру біохімії українського державного медичного університету у 1998 році, спеціалізація – молекулярна біологія. Працює у ФДБНУ «ЦНДІТ» у відділі мікробіології, в лабораторії молекулярно-генетичних методів дослідження з 1998 р. Співробітник центру передового досвіду Мережі супра-національних референс-лабораторій ВООЗ.