Зонди для ПЛР у реальному часі

Зонд для ПЛР у реальному часіє важливим компонентом реакційної суміші. Він є олігонуклеотидом, до якого приєднані молекула флуорофору і молекула гасителя флуоресценції. Послідовність зонда підбирається таким чином, щоб він відпалювався на матрицю між прямим та зворотним праймерами.

Флуоресцентні барвники (флуорофори)- це молекули, які при поглинанні фотона випромінюють світло з більшою довжиною хвилі (тобто флуоресціюють). Існує велика кількість флуорофорів, що відрізняються спектром флуоресценції.

Гаситель флуоресценції- молекула, спектр поглинання якої лежить в області довжин хвиль спектру випромінювання флуорофору. Гасіння флуоресценції відбувається завдяки безвипромінювальному перенесення енергії від молекули флуорофору до молекули гасника та розсіювання енергії.

Схема розщеплення зонда під час реакції ПЛР:

Компанія СИНТОЛ пропонує широкий вибір флуоресцентних барвників та гасників флуоресценції:

Флуоресцентний барвник	λмакс.поглинання, нм	λмакс.флуоресценції, нм
FAM	490	520
R6G	520	550
TAMRA	550	580
ROX	580	610
Cy5	645	670
Cy5.5 new	680	705

Гаситель флуоресценції	λмакс.поглинання, нм	Діапазон гасіння, нм
RTQ-1 new	520	470-570
BHQ-1	535	480-580
BHQ-2	575	550-650
RTQ-2 new	625	580-670
BHQ-3	670	620-730

Як правило, коректне проведення ПЛР-експерименту вимагає встановлення кількох реакцій в одній пробірці одночасно. Для цього необхідно використовувати зонди, мічені різними флуоресцентними барвниками та відповідними гасниками флуоресценції.

Для ефективного гасіння флуоресценції спектр поглинання гасника повинен перекривати спектр флуоресценції флуорофору. Можливий широкий вибір комбінацій флуорофорів та ефективних гасників флуоресценції.

Очищення флуоресцентно-мічених олігонуклеотидів здійснюється у два етапи:

• очищення методом електрофорезу в поліакриламідному гелі;
• очищення методом обернено-фазової ВЕРХ.

ПАМ'ЯТАЙТЕ.Якісне очищення збільшує специфічність і чутливість методу.

Контроль якості:Контроль якості здійснюється в ході очищення зонда в поліакриламідному гелі та при очищенні методом високоефективної рідинної хроматографії. Також контроль якості здійснюється постсинтетично методами спектрофотометрії та капілярного гель-електрофорезу.

Вартість зондів:Пропоновані нами ціни на зонди є найнижчими завдяки використанню власних синтонів – амідофосфітів та CPG флуоресцентних барвників та гасників флуоресценції.Компанія СИНТОЛ пропонує широкий вибір зондів для ПЛР у реальному часі. Ви можете замовити у нас зонди для роботи на будь-яких приладах ПЛР в реальному часі, з будь-якими молекулярними варіантами реалізації методу (TaqMan Probes, Molecular Beacons,Hybridization Probes, Scorpions Probes і т.д.)

---