Тандемні повтори
Фармацевтика, медицина, біологія
Тандемні повтори
Тандемні повтори - послідовності ділянок ДНК, що повторюються. Залежно від розміру, вони поділяються на три підкласи: сателіти, мінісателіти та мікросателіти. Назва «сателіти» походить від спектра оптичної густини при поділі ДНК в градієнті густини розчинника вказує на відмінності відносного середнього вмісту різних нуклеотидів у тандемних повторах порівняно з рештою ДНК.
Розмір ділянок сателітів складає від 100 kbp до більше 1 Mpb, з одиницею, що повторюється зазвичай > 100 bp. У людини добре відомий приклад — альфоїдна ДНК, розташована в центромірі всіх хромосом. Довжина одного повтору становить 171 bp, а весь регіон, що повторюється, становить 3-5% довжини ДНК кожної хромосоми. Інші сателіти мають коротку довжину повтору. Більшість сателітів як людини, так і інших організмів розташовані в центромірі.
Мінісателіти
Розмір повної ділянки мінісателітів становить від 1 kb до 20 kb, з довжиною повтору зазвичай 7-100 bp. Один вид мінісателітів - «змінна кількість тандемних повторень» (англ. Variable number of tandem repeats, VNTR). Його довжина повтору може бути від 9 до 80 пар основ, а ділянки, що повторюються, розташовані в некодуючих регіонах геному. Число повторень для цього мінісателіти може відрізнятися між індивідуумами, ця особливість — основа методу генетичного фінґерпринтінгу. Інший вид мінісателітів – теломери. У людських генеративних клітинах розмір теломеру становить близько 15 kb. У старіючих соматичних клітинах теломери можуть бути значно коротшими. У людини та інших ссавців теломери містять послідовність тандемних повторів GGGTTA.
Мікросателіти
Мікросателіти також відомі як короткі тандемні повтори (англ. Short tandem repeats, STR), так як розмір повтору становить лише від 1 до 6 bp, а повних розмір ділянки зазвичай становить до 150 bp. Подібно до мінісателітів, число повторень для даного мікросателітів може відрізнятися між індивідуумами. Тому мікросателіти також можуть використовуватися для генетичного фінґерпринтінгу.